NiBabel
读/写访问一些常见的神经影像文件格式
该软件包提供对一些常见的医学和神经影像文件格式的读/写访问,包括:ANALYZE(普通,SPM99,SPM2和更高版本),GIFTI,NIfTI1,NIfTI2,MINC1,MINC2,MGH和ECAT以及飞利浦PAR / REC。我们可以读写FreeSurfer几何,注释和形态学文件。DICOM有一些非常有限的支持。NiBabel是的继任者PyNIfTI。
各种图像格式类可以完全或有选择地访问标题(meta)信息,并且可以通过NumPy数组访问图像数据。
网站
目前关于nibabel的文档可以在NIPY nibabel网站上找到。
邮件列表
请将任何问题或建议发送到神经影像邮件列表。
代码
安装nibabel:
pip install nibabel
您也可能对这些内容感兴趣:
- Github上的nibabel代码库;
- 所有版本和当前开发树的文档;
- 从pypi下载当前版本;
- 将当前的开发版本下载为zip文件;
- 下载所有可用的版本。
许可证
Nibabel根据MIT许可条款获得许可。包含在nibabel中的一些代码是根据BSD许可授权的。请参阅nibabel发行版中的COPYING文件。
引用nibabel
请参阅您正在使用的nibabel版本的可用版本。最近发布的版本注释顶部有一个Zenodo数字对象标识符徽章。点击徽章了解更多信息。
文档
- 用户文档 (手动)
- 教程 (相关的成像教程)
- API文档 (综合参考)
- 开发者指南 (对于那些想要贡献的人)
- 开发变更记录 (查看变更内容)
- DICOM概念 (关于实施DICOM阅读的细节)
- 索引 (按关键字访问)
- 搜索页面 (在线和离线全文搜索)
另请参阅开发人员文档页面以了解开发讨论,发布过程等。
作者和贡献者
NiBabel的主要作者是Matthew Brett,Michael Hanke,Ben Cipollini,Marc-AlexandreCôté,Chris Markiewicz,Stephan Gerhard和Eric Larson。作者感谢以下贡献代码和讨论的人(外观粗略):
- 雅罗斯拉夫·O·哈尔琴科
- 克里斯·伯恩斯
- GaëlVaroquaux
- Ian Nimmo-Smith
- Jarrod Millman
- 伯特兰Thirion
- 托马斯·巴林杰
- Cindee麦迪逊
- 瓦伦丁·海内尔
- 亚历山大·格兰福特
- 基督教Haselgrove
- Krish Subramaniam
- Yannick Schwartz
- Bago Amirbekian
- 布伦丹·莫洛尼
- FélixC. Morency
- JB Poline
- 巴西尔Pinsard
- Satrajit Ghosh
- 诺兰尼科尔斯
- Ly Nguyen
- Philippe Gervais
- 德米安Wassermann
- Justin Lecher
- 奥利弗·P·Hinds
- 尼古拉斯N. Oosterhof
- 凯文S.哈恩
- Michiel Cottaar
- Erik Kastman
- Github用户
freec84
- 彼得·菲舍尔
- Clemens CC Bauer
- 塞缪尔圣让
- 格雷戈里·李
- 埃里克·贝克
- Ariel Rokem
- Eleftherios Garyfallidis
- JaakkoLeppäkangas
- Syam Gadde
- 罗伯特·文森特
- 伊万·冈萨雷斯
- 德米安Wassermann
- 保罗·麦卡锡
- 费尔南多·佩雷斯·加西亚
- Venky Reddy
- 马克·海默斯
- Jasper JF van den Bosch
- 班纳特·法布尔
许可证复制
NiBabel是自由软件(啤酒和语音),并被MIT许可证所覆盖。这适用于源代码发布(包括本网站)内的所有源代码,文档,示例和片段。请参阅版权声明手册的附录和许可证的全文。
下载和安装
请在手册中找到详细的下载和安装说明。
支持
如果您在安装软件时遇到问题,或者有关使用方法,文档或与NiBabel相关的任何问题,您可以在NiPy邮件列表中发帖。
邮件列表: | 神经影像@python。org[订阅,存档] |
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我们建议任何使用NiBabel的人都订阅邮件列表。邮件列表是公布对项目进行更改和添加的首选方式。您还可以使用位于NiBabel主页边栏中的邮件列表存档搜索来搜索邮件列表存档。