NiBabel

读/写访问一些常见的神经影像文件格式

该软件包提供对一些常见的医学和神经影像文件格式的读/写访问,包括:ANALYZE(普通,SPM99,SPM2和更高版本),GIFTINIfTI1NIfTI2MINC1MINC2MGHECAT以及飞利浦PAR / REC。我们可以读写FreeSurfer几何,注释和形态学文件。DICOM有一些非常有限的支持。NiBabel是的继任者PyNIfTI

各种图像格式类可以完全或有选择地访问标题(meta)信息,并且可以通过NumPy数组访问图像数据。

网站

目前关于nibabel的文档可以在NIPY nibabel网站上找到

邮件列表

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代码

安装nibabel:

pip install nibabel

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许可证

Nibabel根据MIT许可条款获得许可。包含在nibabel中的一些代码是根据BSD许可授权的。请参阅nibabel发行版中的COPYING文件。

引用nibabel

请参阅您正在使用的nibabel版本可用版本。最近发布的版本注释顶部有一个Zenodo数字对象标识符徽章。点击徽章了解更多信息。

文档

另请参阅开发人员文档页面以了解开发讨论,发布过程等。

作者和贡献者

NiBabel的主要作者是Matthew BrettMichael HankeBen CipolliniMarc-AlexandreCôté,Chris Markiewicz,Stephan GerhardEric Larson。作者感谢以下贡献代码和讨论的人(外观粗略):

  • 雅罗斯拉夫·O·哈尔琴科
  • 克里斯·伯恩斯
  • GaëlVaroquaux
  • Ian Nimmo-Smith
  • Jarrod Millman
  • 伯特兰Thirion
  • 托马斯·巴林杰
  • Cindee麦迪逊
  • 瓦伦丁·海内尔
  • 亚历山大·格兰福特
  • 基督教Haselgrove
  • Krish Subramaniam
  • Yannick Schwartz
  • Bago Amirbekian
  • 布伦丹·莫洛尼
  • FélixC. Morency
  • JB Poline
  • 巴西尔Pinsard
  • Satrajit Ghosh
  • 诺兰尼科尔斯
  • Ly Nguyen
  • Philippe Gervais
  • 德米安Wassermann
  • Justin Lecher
  • 奥利弗·P·Hinds
  • 尼古拉斯N. Oosterhof
  • 凯文S.哈恩
  • Michiel Cottaar
  • Erik Kastman
  • Github用户 freec84
  • 彼得·菲舍尔
  • Clemens CC Bauer
  • 塞缪尔圣让
  • 格雷戈里·李
  • 埃里克·贝克
  • Ariel Rokem
  • Eleftherios Garyfallidis
  • JaakkoLeppäkangas
  • Syam Gadde
  • 罗伯特·文森特
  • 伊万·冈萨雷斯
  • 德米安Wassermann
  • 保罗·麦卡锡
  • 费尔南多·佩雷斯·加西亚
  • Venky Reddy
  • 马克·海默斯
  • Jasper JF van den Bosch
  • 班纳特·法布尔

许可证复制

NiBabel是自由软件(啤酒和语音),并被MIT许可证所覆盖。这适用于源代码发布(包括本网站)内的所有源代码,文档,示例和片段。请参阅版权声明手册附录和许可证的全文。

下载和安装

请在手册中找到详细的下载和安装说明

支持

如果您在安装软件时遇到问题,或者有关使用方法,文档或与NiBabel相关的任何问题,您可以在NiPy邮件列表中发帖。

邮件列表: 神经影像@python。org[订阅存档]

我们建议任何使用NiBabel的人都订阅邮件列表。邮件列表是公布对项目进行更改和添加的首选方式。您还可以使用位于NiBabel主页边栏中的邮件列表存档搜索来搜索邮件列表存档

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